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メチルホスホン酸アミダイドS-メチルホスホン酸アミダイドは、標準的なCEホスホアミダイドのDNA合成プロトコールを用いた合成機で、1つ以上のメチルホスホン酸リンクを持つオリゴDNAを合成する時に使用します。 しかし、脱保護方法や精製方法は、各モノマーによって異なりますので、それぞれの手順については各製品に添付された説明書をご参照下さい。 dCモノマーには、保護基にアセチル基を使用しています。1 この保護基は、切出しステップで水酸化アンモニウムによって切断され、エチレンジアミン エタノール溶液を用いた脱保護処理中はdC塩基への不要な導入反応を防ぎます。
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参考文献(1) M.P. Reddy, F. Farooqui, and N.B. Hanna, Tetrahedron Lett., 1996, 37, 8691-8694.
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メチルホスホアミダイドグレンリサーチでは、長い間、β-シアノエチル(CE)ホスホアミダイドのシアノエチル基が不安定で保護基として利用できない場合には、代わりにメチルホスホアミダイド製品を提供して来ました。 メチル基はチオフェノールで特異的に脱離するので、電荷を持たないヌクレアーゼ耐性のメチルホスホトリエステル結合を合成する為、このようなモノマーの使用が試みられる事がありますが、この結合は水酸化アンモニウム中で不安定で通常のリン酸ジエステルを形成してしまう上、オリゴDNA鎖が若干切断されてしまうので実用化されませんでした。 現在、このような目的には、ウルトラマイルド メチルホスホアミダイドをご提供しております。 このモノマーを使用して合成されたオリゴを、炭酸カリウム メタノール溶液中で脱保護処理するとメチルホスホトリエステル結合が得られます。 この結合は電荷を持たず、その構造はジアステレオマーなので、そのオリゴの取り扱いはとても難しくなります。 このように、通常のウルトラマイルドCEホスホアミダイドと共にこのモノマーを使用すると、キメラ分子の生成が可能になります。 dG残基が比較的多く存在するオリゴDNAの合成には、キャップA試薬に無水フェノキシ酢酸(PAc2O)の使用を推奨しております。 これによって、無水酢酸キャップ用混合液の使用によって起こりうる、dGの保護基であるイソプロピル-フェノキシアセチル基(iPr-Pac)がアセチル基と入れ替わってしまう現象を防ぐ事ができます。
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ウルトラマイルド 溶媒/試薬
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H-ホスホン酸エステル モノマーグレンリサーチのH-ホスホン酸エステル製品は、HPLC分析によって合成確認を行っております。 H-ホスホン酸エステルは、特にホスホアミダイドを利用した化学合成では不可能な、ヌクレオチド間のリンカー修飾に使用されています。 硫化反応は合成機で行うため、このモノマーは、主に放射性標識を施したホスホロチオエートの合成で使用されています。 このモノマー製品は、ABI対応のバイアル包装でご提供しています。
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略号I2 = ヨウ素e
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H-ホスホン酸エステル 試薬全ての溶媒/試薬製品は、最高品質の合成効率を実現するため、厳密な処方によって調整された後、0.2ミクロンの分子篩にかけて微細混入物を取り除いて包装を施しています。
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硫化用試薬グレンリサーチの硫化用試薬は、CEホスホアミダイド法を利用したホスホロチオエート結合の形成に使用します。 この製品には以下のような特性を持たせています。:
硫化用試薬のご注文時には、ご使用の合成機に対応したシラン処理済ボトルも併せてご注文下さい。 試薬のご注文時にこのボトルもご用命頂いた場合、このボトル1本を無料でご提供させて頂きます。 このシラン処理ボトルは、アセトニトリルで洗浄後、十分に乾燥させると再利用が可能です。 シラン処理ボトルの価格は以下の価格表に記載しております。 この試薬は使用時にアセトニトリルで1g/100mLの濃度に希釈して下さい。
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知的所有権この商品は、米国特許No.5,003,097に基づいて使用許諾契約を受けて販売しております。
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